安徽省农业科学院畜牧兽医研究所成立于1960年，是安徽省畜牧兽医领域唯一的综合性、公益性研究所。主要进行畜禽及牧草育种、标准化健康养殖、动物营养与饲料、疾病诊断及综合防治、畜产品加工、循环农业等方面研究，为全省畜牧业的健康持续发展提供全方位的技术服务。
现有在职职工66人，其中科技人员55人，研究员5人，副研究员15人，博士16人，硕士23人。
建筑面积10000多㎡，其中东山养殖试验场房6000 多㎡。在安徽省各地有10多个研发基地。拥有固定资产1867万元。建有动物生物技术实验室、饲料安全检测与生物学评价中心、兽医临床诊断指导中心、肉蛋品控制实验室、畜牧微生物等5个实验室，实验室面积4000多㎡，拥有各类科研仪器607台(套)，其中万元以上大型精密和常规仪器设备100多台套。
积极开展国际学术交流、科技合作活动，曾先后有30多人次到国外进行学术交流和考察，50人次国外学者到本所学术交流。
建所以来，经过几代人的努力，取得了丰硕成果。1982年以来，共获各类科技成果奖42项，其中国家发明奖三等奖1项，部、省级奖26项。出版各类专著、论文集计37册，在国际、全国及省级学术刊物上发表论文500多篇。有1个动物品种(皖系长毛兔)、2个牧草品种通过国家新品种审定，获得1个国家二类新兽药(疫苗)，为安徽省畜牧业的发展做出了一定贡献。
