浙江农林大学动物科技学院前身是浙江林学院林业与生物技术学院的动物学科(组建于2006年)。2010年，浙江林学院更名为浙江农林大学。随着动物学科的蓬勃发展与壮大，2011年7月学校校长办公会议通过了"关于积极筹建动物科技学院"的文件。同年9月，学校聘请浙江大学方维焕教授作为筹建组负责人建设动物科技学院，随后筹建工作启动。
2012年6月，在学校发展战略处的牵头下，学校邀请了中国工程院院士刘秀梵教授等7位专家对动物科技学院建设方案进行了论证。专家们一致认为兽医学与畜牧学是现代农(林)业大学的重要支柱学科，筹建以兽医学和畜牧学两个一级学科为主体的动物科技学院符合当前国内农(林)业大学的发展趋势，对于提高人才培养质量、提升社会服务水平和促进区域经济发展等具有重要意义。
2012年12月学校校长办公会和党委会会议均通过了动物科技学院的筹建方案。从2013年1月1日起，动物科技学院在人事、财务、资产方面"计划单列、统筹管理、资源共享、依托发展"，标志着动物科技学院的发展迈向了新的台阶。
动物科技学院是一所年轻向上、富有激情和朝气的学院。建设中的动物科技学院涵盖畜牧学和兽医学两个一级学科，其中动物营养与饲料科学二级学科为浙江省重点学科。学院现有教职工41人，博士35人，教授9人，副教授13人，其中浙江省***计划入选者1人，浙江省钱江学者特聘教授1人，浙江省151人才第二层次2人、第三层次3人，浙江省高校中青年学科带头人2人，海外留学3年以上教师9人。另外学院聘请兼职教授8人。多位教师在Proceedings of the National Academy of Sciences, PLoS Genetics, Molecular Microbiology, Journal of Virology, Journal of Bacteriology, Journal of Biological Chemistry，Infection and Immunity等行业Top期刊以第一作者发表过高水平学术论文。目前在校本科生382人，研究生37人。
从 2013-2015年，3年多来，动科院新增国家自然科学基金25项，省部级以上项目50余项，新增科研经费5000余万元，新增平台建设经费2000余万元，新增省重点学科1个，新增省级平台1个，新增省级以上人才4人，新增企业奖学金6个，新增浙江省科学技术奖2项，建有全国高校唯一具有CMA检测资质的动物健康检测中心。
